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ontarget研究開(kāi)始于什么時(shí)候,oncotarget and therapy 是 oncotarget子刊么

發(fā)布時(shí)間:2023-04-09 02:20 相關(guān)企業(yè):金話(huà)筒醫(yī)藥

1,oncotarget and therapy 是 oncotarget子刊么

oncotarget雜志怎么樣oncotarget雜志怎么樣oncotarget雜志怎么樣明確的告訴你 不是附屬子刊的關(guān)系!oncotarget是美國(guó)的,曾經(jīng)輝煌的時(shí)候6.28分,但后期為了掙錢(qián)90%都是中國(guó)人投的,版面費(fèi)大概要2W左右,自引率非常高。2018年開(kāi)始已經(jīng)被提出SCI了,貌似是收錄到17年的第58卷,不要再投了,如果投了趕緊撤回來(lái)。oncotarget and therapy 是新西蘭的雜志,去年應(yīng)該是2.61分,18年好像漲到了2.8了,這個(gè)雜志會(huì)中文跟你溝通,對(duì)國(guó)人非常友好。推薦。再次重申 他們兩個(gè)之間沒(méi)有任何關(guān)系!放心投therapy,另外這種問(wèn)題最好去專(zhuān)門(mén)的醫(yī)學(xué)論壇問(wèn),在這很少有人告訴你。是,sci四區(qū)雜志期刊名字 oncotargets and therapy期刊issn 1178-6930 2014-2015最新影響因子 2.311 涉及的研究方向 biotechnology applied microbiology-oncology 出版國(guó)家 england 出版年份 2008 年文章數(shù) 241-

2,如何看待ACEI和ARB聯(lián)合應(yīng)用

血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑和血管緊張素受體阻滯劑聯(lián)合應(yīng)用,利或弊?—關(guān)于ONTARGET研究的思考RAS系統(tǒng)是體內(nèi)調(diào)節(jié)循環(huán)功能和水電解質(zhì)最重要的神經(jīng)體液因素。血管緊張素1I是其中最具生物活性的物質(zhì),它通過(guò)血管緊張素受體發(fā)揮作用,在高血壓、冠心病、心肌重構(gòu)、慢性腎臟病和心力衰竭發(fā)病過(guò)程中扮演著十分重要的角色。大量循證醫(yī)學(xué)證據(jù)表明血管緊張素轉(zhuǎn)換酶抑制劑和血管緊張素受體阻滯劑均能改善上述疾病的預(yù)后,但是兩者作用機(jī)制有所不同,理論上兩類(lèi)藥物聯(lián)合使用可以更全面地抑制RAS(即RAS雙重阻滯),取得更好的臨床效果。但是循證醫(yī)學(xué)的結(jié)果并不完全支持上述推測(cè)。最近在2008美國(guó)心臟病學(xué)會(huì)年會(huì)上公布的ONTARGET研究給我們提供了些有力的證據(jù)。ONTARGET研究簡(jiǎn)介研究背景:以往臨床研究已證實(shí),ACEI對(duì)高血壓患者,以及具有特異性靶器官病變的患者有益。HOPE研究顯示,與安慰劑相比,雷米普利使心肌梗死、卒中和心血管死亡的主要復(fù)合終點(diǎn)降低了22,心血管病死率降低26,心肌梗死發(fā)生率降低2O,卒中發(fā)生率降低32。ACEI和ARB是阻斷RAS的兩類(lèi)常用降壓藥物,由于這兩類(lèi)藥物作用機(jī)制不同,他們應(yīng)有獨(dú)立于降壓效果之外互補(bǔ)的心血管作用的潛力。早在1999年,以加拿大McMaster大學(xué)SalimYusuf教授為首的多位國(guó)際心血管病專(zhuān)家就開(kāi)始設(shè)計(jì)一項(xiàng)臨床研究,希望檢驗(yàn)替米沙坦和雷米普利對(duì)心血管保護(hù)有何異同,以及這兩種藥物合用是否有更佳的效果。旨在證實(shí):①替米沙坦與雷米普利聯(lián)用優(yōu)于單用雷米普利,②單用替米沙坦的效益至少不次于單用雷米普利。試驗(yàn)設(shè)計(jì):該研究納入了有冠心病、腦血管疾病、外周血管疾病、糖尿病伴靶器官損害、但無(wú)心力衰竭的高危25620例患者,入選的患者為最為廣泛的伴有冠心病、腦卒中、短暫性腦缺血發(fā)作、靶器官損傷與糖尿病病史的高危心血管疾病患者,年齡≥55歲。隨機(jī)將其分為替米沙坦(8Omg/d,8542)、雷米普利(10mg/d,8576)和替米沙坦+雷米普利(80mg/d+10mg/d,8502)3組,平均隨訪(fǎng)56個(gè)月。研究主要終點(diǎn)是由心血管死亡、非致死性心肌梗死、非致死性卒中、因充血性心力衰竭而住院組成的主要復(fù)合心血管終點(diǎn)。次要終點(diǎn)是新診斷充血性心力衰竭、心血管血運(yùn)重建術(shù)、新發(fā)糖尿病、認(rèn)知能力下降、癡呆、新發(fā)心房顫動(dòng)和腎病。試驗(yàn)結(jié)果:替米沙坦組、雷米普利組和聯(lián)合用藥組的主要終點(diǎn)事件發(fā)生率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,分別為16.7%、16.5%和16.3%。與雷米普利組相比,替米沙坦組患者咳嗽及血管性水腫發(fā)生率較低,但低血壓癥狀較多見(jiàn)。聯(lián)合用藥組的低血壓癥狀、暈厥及腎功能異常發(fā)生率均顯著高于雷米普利組。試驗(yàn)結(jié)論:ACEI聯(lián)合ARB在高危的心血管患者中減少事件的療效相似,不良反應(yīng)明顯增多,因此不建議ACEI聯(lián)合ARB方案在高危患者中應(yīng)用。臨床意義及評(píng)論:ARB+ACEI盡管在腎臟大量蛋白尿的患者治療中被認(rèn)可,但是在心血管的高?;颊咭餐四I臟病變,在常規(guī)ACEI和大劑量ARB的聯(lián)合治療對(duì)有腎臟缺血的患者則可能存在風(fēng)險(xiǎn),這種風(fēng)險(xiǎn)體現(xiàn)在腎臟功能障礙明顯增加。ONTARGET研究結(jié)果表現(xiàn)出低血壓和腎臟損害的增加,提示ARB+ACEI的聯(lián)合方案并不適合高危的冠心病患者。毫無(wú)疑問(wèn),不管是ACEI或是ARB都是也必將繼續(xù)作為心血管藥物治療的最核心藥物。兩種藥物盡管預(yù)防心腦血管病發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)差別不大,但是仍有跡象顯示ACEI對(duì)心肌梗死與心力衰竭可能更為有效,而ARB可能更有效預(yù)防腦卒中。對(duì)此,選擇有關(guān)患者進(jìn)行專(zhuān)門(mén)的臨床試驗(yàn)研究很有必要,比如,在冠心病患者中探討ACEI是否比ARB更能夠有效預(yù)防心肌梗死、心力衰竭等心臟并發(fā)癥的發(fā)生;在腦卒中患者中研究ARB是否能夠更有效地預(yù)防腦卒中再發(fā)或癡呆。ACEI和ARB聯(lián)用應(yīng)僅限于極高風(fēng)險(xiǎn)患者,比如單用ACEI仍不能控制癥狀的嚴(yán)重心衰患者、單獨(dú)使用ARB無(wú)效的嚴(yán)重蛋白尿患者或腎功能不全患者,但在治療過(guò)程中應(yīng)密切監(jiān)測(cè)患者的血壓水平,避免影響灌注的嚴(yán)重低血壓發(fā)生,也就是不管治療對(duì)象是否是高血壓患者,在使用這些藥物時(shí),都應(yīng)密切關(guān)注血壓而不是撇開(kāi)血壓奢談降壓以外的器官保護(hù)作用。

保護(hù)心血管要學(xué)會(huì)\"雙管齊下\" 高血壓患者要接受及時(shí)、持久的降壓治療,從而實(shí)現(xiàn)血壓達(dá)標(biāo)的理念如今已經(jīng)被越來(lái)越多的人所接受。而同樣重要的是,在良好控制血壓的同時(shí)還要實(shí)現(xiàn)對(duì)心血管的保護(hù),降低心肌梗死、腦卒中、心血管死亡等并發(fā)癥的風(fēng)險(xiǎn)。日前,在勃林格殷格翰公司新型降壓藥美嘉素的上市新聞發(fā)布會(huì)上,人們了解到了這一創(chuàng)新藥物在同時(shí)控制血壓和保護(hù)心血管“一箭雙雕”的效果。通過(guò)平穩(wěn)降壓實(shí)現(xiàn)保護(hù)心血管的終極目標(biāo)已成為高血壓患者治療的追求,特別是對(duì)于那些本身已有糖尿病、高血脂等心血管高危因素的患者來(lái)說(shuō)更是如此。為了實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),人們通常會(huì)選擇經(jīng)過(guò)大型臨床試驗(yàn)證實(shí)的療效確切的藥物進(jìn)行聯(lián)合治療。有25,620名患者參與的ONTARGET研究就提供了一個(gè)很好的選擇,結(jié)果發(fā)現(xiàn):美卡素(替米沙坦)是ARB(血管緊張素II受體拮抗劑)類(lèi)降壓藥物中唯一被臨床研究證實(shí)具有全面心血管保護(hù)作用的產(chǎn)品,對(duì)于伴心血管高風(fēng)險(xiǎn)患者更是這樣?;诖?,日前歐盟委員會(huì)已批準(zhǔn)美卡素(替米沙坦)用于降低那些具有高危風(fēng)險(xiǎn)患者的心血管疾病發(fā)病率,包括動(dòng)脈粥樣硬化(血栓形成性)心血管疾病(冠心病、卒中、外周動(dòng)脈疾病史)或2型糖尿病伴有靶器官受損的患者。美國(guó)FDA也于今年早些時(shí)候批準(zhǔn)了美卡素(替米沙坦)類(lèi)似的心血管保護(hù)適應(yīng)癥。對(duì)于同時(shí)存在高血脂、糖尿病或糖耐量異常、吸煙、肥胖等心血管高危因素的高血壓患者而言,其降壓標(biāo)準(zhǔn)更為嚴(yán)格,而控制血壓達(dá)標(biāo)通常也會(huì)比較困難,需要審慎選擇安全、確切、強(qiáng)效的降壓藥物,并在有效降壓的同時(shí)保護(hù)心血管。因?yàn)檫@部分患者如果不能有效降壓,其心血管并發(fā)癥的發(fā)生率將成倍上升。專(zhuān)家強(qiáng)調(diào),大量研究結(jié)果已經(jīng)證實(shí),具有獨(dú)特心血管保護(hù)作用、降壓效果更強(qiáng)、半衰期更長(zhǎng)的美嘉素?對(duì)于具有心血管高危因素的高血壓病人尤其適合,可以明顯降低心血管事件的發(fā)生率。

4,拜心同降壓藥有保護(hù)心腦血管的作用嗎

通過(guò)平穩(wěn)降壓實(shí)現(xiàn)保護(hù)心血管的終極目標(biāo)已成為高血壓患者治療的追求,特別是對(duì)于那些本身已有糖尿病、高脂血癥等心血管高危因素的患者來(lái)說(shuō)更是如此。為了實(shí)現(xiàn)上述目標(biāo),人們通常會(huì)選擇經(jīng)過(guò)大型臨床試驗(yàn),以準(zhǔn)確評(píng)價(jià)藥物降壓以外的心血管保護(hù)作用?! ∧I素-血管緊張素抑制劑  血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑(ACEI)和血管緊張素Ⅱ受體拮抗劑(ARB)均通過(guò)作用于腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)(RAAS)通路的不同位點(diǎn)來(lái)阻斷RAAS的激活。理論上,ACEI和ARB產(chǎn)生的效果應(yīng)該是相近的,但在臨床應(yīng)用中的確觀(guān)察到了這兩類(lèi)藥物在療效和不良反應(yīng)上的不同?! NTARGET研究是一項(xiàng)大規(guī)模、多國(guó)、多中心、隨機(jī)、雙盲、平行、對(duì)照試驗(yàn),共有40個(gè)國(guó)家的733個(gè)中心參加,納入了31546例患者(大于55歲,冠心病或糖尿病合并其他危險(xiǎn)因素,無(wú)心衰證據(jù)者)。隨機(jī)給予雷米普利(10mg/d)、替米沙坦(80mg/d)或二者聯(lián)用,平均隨訪(fǎng)56個(gè)月,比較三種治療方案的療效和安全性。同時(shí),對(duì)于初始入組時(shí)不能耐受ACEI的患者,進(jìn)入亞研究TRANSCEND,隨機(jī)給予替米沙坦(80mg/d)和安慰劑對(duì)照,比較對(duì)不能耐受ACEI的患者是否能從替米沙坦的治療中獲益以及耐受性問(wèn)題。  ONTARGET研究結(jié)果表明,替米沙坦在減少心血管死亡、心肌梗死、腦卒中和心衰住院方面的作用不劣于雷米普利。同時(shí),替米沙坦表現(xiàn)出比雷米普利更好的耐受性,雷米普利治療組有360例患者(4.2%)因咳嗽而停止治療,而替米沙坦組為93例(1.1%)。兩藥聯(lián)合應(yīng)用并不優(yōu)于雷米普利單藥治療,且兩藥聯(lián)用增加了不良事件如低血壓、暈厥和腎功能不全的發(fā)生率。TRANSCEND研究結(jié)果表明,對(duì)不能耐受ACEI的患者,替米沙坦在減少心血管死亡、心肌梗死、腦卒中和心衰住院方面的作用和安慰劑沒(méi)有顯著差異。  究其原因,其一,ARB只能阻斷血管緊張素Ⅱ1型受體(AT1R),但ACEI由于減少了血管緊張素Ⅱ(AngⅡ)的生成,能同時(shí)減弱AngⅡ和AT1R及血管緊張素Ⅱ2型受體(AT2R)的結(jié)合。其二,ACEI抑制ACE的同時(shí)激活了ACE2-Ang-(1-7)-Mas軸,能促進(jìn)血管緊張素Ⅰ(AngⅠ)生成Ang-(1-7),后者具有舒血管功能,而ARB此方面作用較弱。其三,ACEI抑制緩激肽及其他參與炎癥反應(yīng)的肽類(lèi)物質(zhì)的分解,炎癥介質(zhì)積聚刺激肺部的感受器引起咳嗽,這解釋了ARB耐受性?xún)?yōu)于ACEI的原因?! ♀}離子拮抗劑  降低卒中發(fā)生率 BPLTC薈萃分析顯示,與安慰劑相比,各種降壓藥均可顯著降低卒中風(fēng)險(xiǎn)。但直接對(duì)比活性藥物發(fā)現(xiàn),CCB預(yù)防卒中的療效顯著優(yōu)于ACEI,也優(yōu)于利尿劑及β受體阻滯劑,其他薈萃分析也得出相似結(jié)果。ALLHAT研究亞組分析顯示,與賴(lài)諾普利相比,氨氯地平可使卒中風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)一步降低23%(P=0.003)。最近一項(xiàng)大型薈萃分析顯示,與ACEI相比,CCB在預(yù)防卒中方面能獨(dú)立提供14%降壓以外的益處。STONE、SYS-China和FEVER研究均證實(shí)CCB減少卒中發(fā)生的突出療效?! REVENT研究顯示,氨氯地平較安慰劑顯著減少冠心病患者的頸總動(dòng)脈內(nèi)膜中層厚度(-0.013mm對(duì)+0.033mm,P=0.007)。此外,氨氯地平還是唯一采用血管腔內(nèi)超聲技術(shù)顯示能有效阻遏和消退冠狀動(dòng)脈粥樣斑塊的降壓藥。  因此,氨氯地平在冠心病預(yù)防方面優(yōu)勢(shì)明顯。苯磺酸氨氯地平還有經(jīng)冠脈造影證實(shí)的冠心病的適應(yīng)證。但同時(shí)應(yīng)注意,CCB不同于RASS抑制劑,不具類(lèi)效應(yīng)。薈萃分析顯示,氨氯地平的冠心病預(yù)防作用優(yōu)于血管緊張素受體拮抗劑(ARB),與ACEI相似。  減少新發(fā)腎損害 高血壓與腎臟損害密切相關(guān),血壓升高導(dǎo)致腎血流量(RBF)降低,腎小管損傷,腎小球?yàn)V過(guò)率(GFR)降低,出現(xiàn)蛋白尿癥狀。因此,腎臟功能不僅可用來(lái)評(píng)估高血壓的進(jìn)程,還可作為判斷高血壓患者心血管預(yù)后的重要因素。研究表明,氨氯地平聯(lián)合ACEI可有效減少蛋白尿。氨氯地平可作用于L、N-型鈣離子通道,均衡擴(kuò)張入球和出球小動(dòng)脈作用,因此改善腎臟血流,且不增加腎小球內(nèi)壓。此外,氨氯地平還可通過(guò)增加NO合成,增加腎血流,改善腎灌注?! ?duì)于高血壓伴腎損害的患者,提供有效降壓并且保護(hù)腎臟的治療,可延緩高血壓進(jìn)展,帶來(lái)長(zhǎng)期的心血管保護(hù),同時(shí)預(yù)防終末期腎病的發(fā)生。為了實(shí)現(xiàn)這一目的,聯(lián)合用藥意義重大。歐洲最大的高血壓研究ASCOT和全球首個(gè)采用單片復(fù)方制劑的高血壓研究ACCOMPLISH均顯示:與對(duì)照組相比,氨氯地平聯(lián)合RAAS抑制劑的方案可有效降低血壓,心血管事件,減少新發(fā)腎損害?! 】傮w來(lái)講,血壓水平與心血管疾病危險(xiǎn)呈連續(xù)正相關(guān),并獨(dú)立于其他危險(xiǎn)因素。美國(guó)JNC7高血壓指南指出,血壓越高,患心血管疾病、卒中及腎病的風(fēng)險(xiǎn)越高;年齡40~89歲、血壓>115/75mmHg的個(gè)體,收縮壓每增加20mmHg或舒張壓每增加10mmHg,其缺血性心臟病及卒中死亡風(fēng)險(xiǎn)加倍。因此,臨床上,醫(yī)生需要明確降壓治療的目的不僅僅是為了降低血壓本身,還應(yīng)逆轉(zhuǎn)靶器官損害、預(yù)防心血管疾病進(jìn)展及心血管事件的發(fā)生。更重要的是,應(yīng)根據(jù)患者的具體情況制定個(gè)體化的血壓目標(biāo),采取更積極的血壓控制策略盡早干預(yù)。

5,冠心病高血壓處方點(diǎn)評(píng)求助

一般是應(yīng)該有利尿劑,處方寧可CCB、ACEI、ARB、β受體阻滯劑都上,獨(dú)缺利尿劑,按正常思路,恐怕是另有原因如痛風(fēng)什么之類(lèi),這里ASP也沒(méi)上,ASP對(duì)痛風(fēng)也有影響,純屬猜測(cè),需要西川ZB藥師去了解。冠心病ACRI/ARB選一種,β受體阻滯劑要上。多藥并用,如果不是為開(kāi)藥而開(kāi)藥,血壓應(yīng)是極難控制,減藥難度大。支持聯(lián)合使用ACEI與ARB治療腎臟疾病的COOPERATE試驗(yàn)最終被證明是虛假的。 2009年10月10日,英國(guó)雜志《柳葉刀》Lancet發(fā)表了有關(guān)COOPERATE試驗(yàn)的撤稿聲明,明確指出2003年發(fā)表的COOPERATE試驗(yàn)研究報(bào)告的第一作者中尾(Nakao)在該研究中存在嚴(yán)重的學(xué)術(shù)不端行為。述評(píng)者認(rèn)為,在專(zhuān)業(yè)方面,COOPERATE撤稿可以在很大程度上結(jié)束一場(chǎng)較長(zhǎng)時(shí)間的激烈爭(zhēng)論,那就是聯(lián)合使用ACEI與ARB的問(wèn)題。這種聯(lián)合所帶來(lái)的獲益非常有限,但所帶來(lái)的傷害非常明確,早期的RESOLVD試驗(yàn)和近期發(fā)表的ONTARGET試驗(yàn)都證明了這一點(diǎn)。因此,即便不禁止聯(lián)合,也應(yīng)盡可能減少這兩種藥物的聯(lián)合使用。2010版《中國(guó)高血壓防治指南》認(rèn)為,ACRI+ARB屬于“主要推薦應(yīng)用的優(yōu)化聯(lián)合治療方案”、“次要推薦使用的可接受聯(lián)合治療方案”之后的第三種“不常規(guī)推薦的但必要時(shí)可慎用的聯(lián)合治療方案”。2014年4月11日,歐洲藥品管理局(EMA)發(fā)布警告:避免聯(lián)用兩種在腎素-血管緊張素-醛固酮系統(tǒng)(RAS)有獨(dú)立作用的藥物。作用于RAS系統(tǒng)的幾類(lèi)藥物包括血管緊張素受體拮抗劑(ARB)、血管緊張素轉(zhuǎn)換酶抑制劑(ACEI)和直接腎素抑制劑。特別是糖尿病腎病的患者,不應(yīng)聯(lián)合使用ARB和ACEI。冠心病的ABCDE:ACEI(血管緊張素轉(zhuǎn)換酶抑制劑) Aspirin(阿司匹林)β-blocker(β受體阻滯劑)Blood pressure control(控制血壓)Cholesterol lowering (降低膽固醇) Cigarette quitting(戒煙)Diabetes control (控制糖尿?。?Diet(合理飲食)Exercise(適度運(yùn)動(dòng)) Education(健康教育)

6,導(dǎo)流罩的基本信息

對(duì)于廂式半掛車(chē)來(lái)說(shuō),由于牽引車(chē)與半掛車(chē)之間均有1m左右的間距,如果行駛中遇有側(cè)向風(fēng)會(huì)產(chǎn)生擾流,也會(huì)增大空氣阻力;因此,2013年有些車(chē)型已增有擋側(cè)風(fēng)擾流的裝置。 半掛車(chē)導(dǎo)流罩又稱(chēng)導(dǎo)風(fēng)板,可以改善汽車(chē)的空氣動(dòng)力性,是提高汽車(chē)的生產(chǎn)效率、降低燃料消耗、改善使用性能的重要措施。對(duì)于迎風(fēng)面積大,行駛速度高,總體上流線(xiàn)性差的汽車(chē)列車(chē)、廂式半掛車(chē)等專(zhuān)用汽車(chē),顯得尤為重要。因此,高速公路上用的專(zhuān)用汽車(chē)、列車(chē)大都裝有導(dǎo)流罩。隨著汽車(chē)技術(shù)和高速公路的發(fā)展,汽車(chē)行駛速度日益提高,汽車(chē)在行駛時(shí)與空氣相互作用的氣動(dòng)阻力也越來(lái)越顯著,它在很大程度上影響著汽車(chē)的經(jīng)濟(jì)性、動(dòng)力性和穩(wěn)定性。汽車(chē)空氣動(dòng)力學(xué)數(shù)值模擬發(fā)展迅速,而通過(guò)對(duì)其進(jìn)行空氣動(dòng)力學(xué)性能的優(yōu)化,降低空氣阻力系數(shù),提高燃油經(jīng)濟(jì)性,可產(chǎn)生相當(dāng)可觀(guān)的經(jīng)濟(jì)效益。廂式貨車(chē)的廂體高于駕駛室。從而降低空氣阻力系數(shù),所以,廂式貨車(chē)安裝導(dǎo)流罩更加必要。導(dǎo)流罩的使用,為綠色貨運(yùn)做了貢獻(xiàn),對(duì)解決貨運(yùn)業(yè)節(jié)能減排難題提出了新的思路和解決辦法。2013年已有多家專(zhuān)業(yè)生產(chǎn)導(dǎo)流罩的廠(chǎng)家,綠色貨運(yùn)正在向我們前進(jìn)!就有人問(wèn),生信的文章能發(fā)到多少分?如果你是像華科薛宇教授一樣的大牛,弄一套算法,編一個(gè)生信分析工具,十幾分妥妥的,引用量杠杠的。但是,那是大牛,一般來(lái)說(shuō),按「常規(guī)套路」出牌的這種生信分析文章分值在 0-2 分之間。但也有些不做實(shí)驗(yàn)的生信分析文章能發(fā)到個(gè) 4-5 分,那么生信分析的文章怎么樣能達(dá)到一個(gè)比較高的層次呢? 這里,我們給大家分享兩篇文章來(lái)說(shuō)一說(shuō)一些進(jìn)階的文章思路,一篇是發(fā)表在我們的老朋友「oncotarget」上的,另一篇是發(fā)表在「journal of proteome research」(if = 4.1)上的。 先看 oncotarget 這篇「genomic expression differences between cutaneous cells from red hair color individuals and black hair color individuals based on bioinformatic analysis」,文章是做的黑色素瘤的兩種不同表型的個(gè)體的差異基因的生信分析。 abstract 里說(shuō)到 mc1r 這個(gè)基因的突變會(huì)導(dǎo)致高患癌率的 rhc 表型兩種不同的表型,其中 rhc 表型會(huì)增加皮膚癌的發(fā)生率,那么 mc1r 的突變究竟影響了哪些基因?文章通過(guò) ppi 網(wǎng)絡(luò)分析,分別對(duì)比分析兩個(gè)不同表型(rhc 和 bhc)的正常皮膚細(xì)胞和癌細(xì)胞中的差異基因。結(jié)果表明,在癌細(xì)胞的對(duì)比中沒(méi)有差異,而在正常皮膚細(xì)胞中篩選出 23 個(gè) hub 基因,并且其中 8 個(gè)基因異常表達(dá),這一結(jié)果提示這 8 個(gè)基因的異常表達(dá)可能是 rhc 表型患癌風(fēng)險(xiǎn)提高的重要原因。 這篇文章利用了 3 個(gè)數(shù)據(jù)包進(jìn)行綜合分析,從而得到了一個(gè) novel 的結(jié)論,文章利用 gse44805 中的差異基因構(gòu)建 ppi 網(wǎng)絡(luò)篩選 hub 基因,再利用別的數(shù)據(jù)包中的測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證這些基因確實(shí)存在異常表達(dá),多方驗(yàn)證說(shuō)明自己生信分析結(jié)果是可靠的。雖然作者一點(diǎn)實(shí)驗(yàn)也沒(méi)有做,但是從數(shù)據(jù)量還有可靠性上來(lái)說(shuō),可能比自己辛辛苦苦地做小樣本量測(cè)序還要靠譜。 文章中的分析方法(差異基因以及 ppi 分析)都是我們非常熟悉的。篩選出差異基因,將上調(diào)和下調(diào)的基因分別構(gòu)建 ppi 網(wǎng)絡(luò),得到文中的 4 張圖(不管怎么說(shuō),這圖的顏值比上一期套路中分析的文章要高得多)。 這張圖的構(gòu)建方法這里不再贅述 小結(jié) 這篇文章的方法完全是可以借鑒和復(fù)制的,難點(diǎn)在于找到足夠多的具有相似性和可比性的數(shù)據(jù)結(jié)果,以及找到一個(gè)合適的切入點(diǎn)得到一個(gè)相對(duì) novel 的結(jié)論。 下面看 journal of proteome research 上的這篇文章「weighted protein interaction network analysis of frontotemporal dementia」。 一看這流程圖就覺(jué)得這文章是生信專(zhuān)業(yè)的人做的文章。(本宮上學(xué)的時(shí)候,就覺(jué)得我們生命學(xué)院的學(xué)生都是碼農(nóng),生物信息專(zhuān)業(yè)、生物醫(yī)療工程、生物科學(xué)這些專(zhuān)業(yè)的人天天都在編代碼,完全感受不出生物專(zhuān)業(yè)的氣息。) 這文章講得啥咧,就是先選出 13 個(gè)種子基因,然后根據(jù) ppi 數(shù)據(jù)庫(kù)中蛋白質(zhì)互作關(guān)系構(gòu)建這 13 個(gè)種子基因的第一層網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)。 再以第一層網(wǎng)絡(luò)為種子構(gòu)建第二層網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)(然后電腦就死機(jī)了)。 然后分析第二層網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)鋵W(xué)結(jié)構(gòu),從中篩選出 hub 基因(圖中綠點(diǎn)表示最初的 13 個(gè)種子基因,藍(lán)點(diǎn)表示第一層的基因)。在構(gòu)建過(guò)程中,隨著基因數(shù)量的不斷增加,最先選出的 13 個(gè)種子基因未必就是后來(lái)的 hub 基因。文中還設(shè)置了對(duì)照組,并詳細(xì)講述了這 13 個(gè)種子基因的篩選方法。因?yàn)檎麄€(gè)分析過(guò)程都是建立在生信分析的基礎(chǔ)上,屬于完全架空的,所以整個(gè)研究過(guò)程十分講究邏輯上的嚴(yán)謹(jǐn)性。 小結(jié) 之所向大家介紹這篇文章,是覺(jué)得這種思路在生信分析的文章中可以借鑒,種子基因的選擇可以通過(guò)臨床上疾病中基因突變的概率來(lái)進(jìn)行篩選,然后構(gòu)建兩層 ppi 網(wǎng)絡(luò),進(jìn)行 go,kegg 分析,從而預(yù)測(cè)新的未知的疾病相關(guān)基因,如果后續(xù)能從別的數(shù)據(jù)包中得到表達(dá)量的驗(yàn)證或者是自己在臨床樣本中進(jìn)行驗(yàn)證,那么整個(gè)文章的內(nèi)容將會(huì)更加豐富。 局限性:ppi 數(shù)據(jù)庫(kù)中其實(shí)很多蛋白質(zhì)互作結(jié)果是沒(méi)有意義的,因?yàn)樵趯?shí)際生物體中很多蛋白質(zhì)互作情況是不可能發(fā)生的,只有在實(shí)驗(yàn)人為干預(yù)情況下才會(huì)發(fā)生。