（1）新生兒肝酶系統(tǒng)相對不足，腎臟排泄能力差。一些毒性抗菌藥物，如氯霉素和磺胺藥物，主要由肝臟代謝，氨基糖竹、萬古霉素、多粘菌素、四環(huán)素和呋喃藥物，應(yīng)盡量避免應(yīng)用于兒童。

（2）四環(huán)素（四環(huán)素、地霉素、地美環(huán)素、多西環(huán)素、米諾環(huán)素）可與新形成的骨骼和牙齒中沉積的鈣刺痛，導(dǎo)致牙釉質(zhì)發(fā)育不全（黃褐牙），容易齲齒，禁止新生兒或8歲以下兒童。

(3)氨基糖苷類抗生素(鏈霉素、慶大霉素、卡那霉素、新霉素、阿米卡星)嚴(yán)重?fù)p害兒童腎臟和聽神經(jīng)。嬰兒年齡越小，腎功能發(fā)育不良，這些藥物排泄越慢。因此，藥物性腎炎和聽神經(jīng)功能障礙往往導(dǎo)致耳聾，一些兒童導(dǎo)致永久性聽力喪失和聽力喪失。

(4)氟喹諾酮類藥物(諾氟沙星、氧氟沙星、依諾沙星、環(huán)丙沙星、培氟沙星、洛美沙星、左氧氟沙星、司帕沙星)最突出的不良反應(yīng)是會損傷幼動物的軟骨，導(dǎo)致承重骨關(guān)節(jié)細(xì)胞出現(xiàn)水泡和損傷。雖然在人類中還沒有發(fā)現(xiàn)，但少數(shù)病例出現(xiàn)了嚴(yán)重的關(guān)節(jié)疼痛和炎癥。因此，不應(yīng)用于骨骼系統(tǒng)未完全發(fā)育的18歲以下兒童。

(5)氯霉素可引起再生障礙性貧血、白細(xì)胞減少等不良反應(yīng)，尤其是長期、大量使用時，不適合兒童使用。